Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms