Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms