Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms