Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms