Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms