Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms