Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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