Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms