Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3R4Q99570 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms