Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms