Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC7Q96M83 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC7Q96M83 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms