Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCZQ96LD1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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