Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms