Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPGRIP1Q96KN7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms