Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDLIM2Q96JY6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms