Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMNQ96JQ2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms