Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms