Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms