Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
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