Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BICD1Q96G01 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BICD1Q96G01 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms