Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE2Q96FN4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms