Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms