Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms