Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHFRQ96EP1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms