Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG2BQ96BY7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG2BQ96BY7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG2BQ96BY7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG2BQ96BY7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG2BQ96BY7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG2BQ96BY7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG2BQ96BY7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG2BQ96BY7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms