Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRIM63Q969Q1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRIM63Q969Q1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRIM63Q969Q1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRIM63Q969Q1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRIM63Q969Q1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRIM63Q969Q1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRIM63Q969Q1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRIM63Q969Q1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRIM63Q969Q1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRIM63Q969Q1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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