Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

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Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRUQ92729 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
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