Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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RABGGTAQ92696 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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RABGGTAQ92696 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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RABGGTAQ92696 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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RABGGTAQ92696 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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RABGGTAQ92696 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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RABGGTAQ92696 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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