Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms