Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms