Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATAD1Q8NBU5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD1Q8NBU5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms