Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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FAM71DQ8N9W8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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FAM71DQ8N9W8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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FAM71DQ8N9W8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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FAM71DQ8N9W8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM71DQ8N9W8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM71DQ8N9W8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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