Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms