Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms