Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms