Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLNKQ7Z7G1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms