Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms