Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms