Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC149Q6ZUS6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms