Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA0408Q6ZU52 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms