Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPGS1Q6ZTW0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms