Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms