Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC129Q6ZRS4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms