Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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