Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC4Q6P2E9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC4Q6P2E9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC4Q6P2E9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC4Q6P2E9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC4Q6P2E9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC4Q6P2E9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC4Q6P2E9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC4Q6P2E9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC4Q6P2E9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC4Q6P2E9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC4Q6P2E9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC4Q6P2E9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC4Q6P2E9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC4Q6P2E9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC4Q6P2E9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms