Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms