Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms