Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf140Q5VVS0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms