Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms