Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNNI3KQ59H18 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms